As publicações do MAE-UFPR filiam-se a duas referências: as publicações de caráter didático e aquelas de interesse acadêmico. As de caráter didático destinam-se a estudantes e professores da rede de ensino fundamental e médio, são obras distribuídas gratuitamente para museus, escolas e bibliotecas; as publicações acadêmicas abrangem o acervo, as pesquisas, as exposições e, eventualmente, obras temáticas de interesse para os trabalhos do museu. Os catálogos podem ser utilizados como referência didática para uso em sala de aula ou, ainda, como ferramenta de pesquisa acadêmica.
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